Руководитель проекта
Касымбекова Шинара Николаевна
кандидат ветеринарных наук
Scopus Author ID:57202643050
Researcher ID: AAF-7874-2021
ORCID: ID 0000-0003-2992-8817
О проекте
Актуальность
С помощью высокопроизводительного секвенирования исследователи получат данные обо всех микрорганизмах, в том числе и некультивируемые, обитающих в кишечнике лошадей Казахской породы, из различных географических областей, идентифицируют виды и определят их эпизоотологическое значение.
Цель
Целью проекта является изучение видового разнообразия сообществ микроорганизмов верхних дыхательных путей и кишечника аборигенных пород лошадей методом высокопроизводительного секвенирования нового поколения, идентификация возбудителей, включая некультивируемые, и биоинформатический анализ микробиома для применения в селекционно-ветеринарной генетике.
Достигнутые результаты
Проведено высокопроизводительное метагеномное секвенирование по 16S рРНК, выделенных ДНК из образцов свежевыделенных фекалий и носоглоточных мазков, взятых от лошадей из различных регионов Казахстана. Будет проведен эволюционный и филогенетический анализ микроорганизмов. Для биоинформационного анализа полученные последовательности будут собраны и обработаны в программе Geneious. Будет создан информационный бюллетень по микробиому лошадей различных регионов Казахстана. Будут опубликованы 2 статьи имеющих процентиль по CiteScore в базе Scopus не менее 35 (тридцати пяти).
Список публикаций и патентов
1. Ибадуллаева А.Ә., Асанбаев Т.Ш., к.с/х.н., Хамзина А.К., PhD Касымбекова Ш.Н. Оценка ДНК из образцов казахских пород лошадей типа жабе и адайского типа для 16S рРНК секвенирования.
Научнo-практический журнал Западно-Казахстанского аграрно-технического университета имени Жангир хана. Ғылым және білім Наука и образование Science and education 1-болім № 4-1 (69) 2022. - С. 70-78
https://nauka.wkau.kz/index.php/gbj/article/view/1078
2. D.I. Kabylbekova , Zh. Khamzina, K.P. Aubakirova , A.A. Ibadullayeva. Evaluation and comparison of three methоds оf DNA extractiоn frоm Kazakh horse of the type Zhabe. ВЕСТНИК КАРАГАНДИНСКОГО УНИВЕРСИТЕТА. Серия БИОЛОГИЯ. МЕДИЦИНА. ГЕОГРАФИЯ. № 1(109)/2023. С. 69-75. https://dist.buketov.edu.kz/apart/2023-109-1/10.pdf
Информация для потенциальных пользователей
Изучение метагенома лошадей Казахской породы, из различных регионов Казахстана даст базовую эпизоотологическую информацию о патогенах, что позволит быстро идентифицировать возможные источники зоонозных инфекций и их последующий контроль.
