Жоба туралы
Жоба жетекшісі
Орынханов Қанат Аманжолович
ветеринария ғылымдарының кандидаты
Scopus Author ID: 56983046100
Researcher ID: co/rid97599
ORCID: 0000 0001 6736 0498
Өзектілігі
Ұсынылған зерттеу жобасы қазақ түйелерінің қазіргі популяциясының генетикалық әртүрлілігін, популяция құрылымын, бейімделу механизмдерін және жалпы генетикалық әлеуетін зерттеуге бағытталған. Бұл зерттеу жануарлардың репрезентативті үлгісінде озық толық геномдық секвенирлеуді (WGS) жүргізу және генетикалық жақсарту бағдарламалары, сақтау жөніндегі күш-жігер, элиталық асыл тұқымды ядро құру және Қазақстан Республикасында дәстүрлі түйе шаруашылығы секторының болашақтағы табысты дамуы үшін берік негіз ұсыну арқылы қазақстандық түйелердің генетикалық құрамы туралы білімдегі олқылықтарды толтыруға арналған.
Қазақстанда түйелердің екі негізгі түрі қатар өмір сүреді: бактриан (қос өркешті) және дромедар (бір өркешті), олар әртүрлі экологиялық аймақтарда тұрады және көбінесе сол фермаларда қиылысады. Түйелер құрғақ жағдайларға төзімділігі және сүт пен ет өндірісінің арқасында жергілікті экономикаға қосқан үлесі арқасында елдегі ауылшаруашылық жануарларының дәстүрлі және маңызды түрі болып табылады. Дегенмен, түйе өсірудің қазіргі тәжірибелері генетикалық бағалауды қамтымайды, бұл асыл тұқымды бағдарламалар мен күтімнің тиімсіздігіне әкеледі. Сонымен қатар, түйе сүтіне, әсіресе дромедарларға деген сұраныстың артуы түйелерді импорттауға және оларды ғылыми нұсқаулықсыз кесіп өтуге әкелді. Қазақстандық түйелер туралы геномдық деректердің болмауы сүттің шығуы және өсу қарқыны сияқты экономикалық маңызды белгілерді жақсарту үшін құрылымдық асыл тұқымды бағдарламалардың дамуына кедергі келтіреді. Сонымен қатар, түйе популяцияларына қауіп төндіретін жаһандық жылыну сияқты қоршаған ортаның өзгеруіне әсер ету олардың генетикалық бейімделуін жақсырақ түсінуді талап етеді. Түйелердің тарихи және экономикалық маңыздылығына қарамастан, Қазақстанда әлі күнге дейін белгіленген асыл тұқымды бағдарлама жоқ және олардың геномдық профилін, құрылымын, әртүрлілігін және тұтастай алғанда генетикалық әлеуетін шектеулі түсінік бар.
Мақсаты
Жобаның негізгі мақсаты-WGS технологиясын пайдалана отырып, бейімделуге байланысты геномдық аймақтарды анықтай отырып, қазақстандық түйелердің геномдық бейінін, генетикалық әртүрлілігін, популяция құрылымын және жалпы генетикалық әлеуетін талдау. Бұл түйелердің өнімділігі мен төзімділігін арттыруға бағытталған асылдандыру бағдарламаларының негізін қамтамасыз етеді, бұл түйе шаруашылығының тұрақты дамуына және оларды Қазақстанда сақтау жөніндегі күш-жігерге үлес қосады. Жоба Қазақстандағы түйе фермерлері мен селекционерлерінің алдында тұрған мәселелерді шешу үшін геномика, биоинформатика, зоотехника және экологиялық ғылымды біріктіреді.
Күтілетін және қол жеткізілген нәтижелер
Түйе геномикасы бойынша осы жобаның негізгі күтілетін нәтижесі қазақ түйелерінің популяциялық құрылымын, генетикалық әртүрлілігін, бейімделу негізінде жатқан генетикалық механизмдерін және жалпы генетикалық әлеуетін түсінуде елеулі ілгерілеу болып табылады.
Алғаш рет қазақ түйелерінің эталондық популяциясы ретінде пайдаланылатын кешенді геномдық деректер жиынтығы жасалады. Ол төмен тығыздықтағы панельдердің генотиптерін SNP-жоғары тығыздықтағы генотиптерге импутациялау үшін пайдаланылады, бұл одан әрі геномдық зерттеулер үшін ғана емес, сонымен қатар генотиптеу шығындарын азайту үшін, демек, қазақ түйелерін өсірудің геномдық бағдарламаларына жәрдемдесу үшін пайдалы. Сонымен қатар, SNPs бар жалпыға қол жетімді геномдық мәліметтер базасы құрылады, гаплотиптер мен құрылымдық нұсқалар ұсынылады. Популяциялық құрылым мен геномдық әртүрліліктің нәтижелері асыл тұқымды және қорғау жөніндегі күш-жігер үшін, әсіресе қазіргі қазақ түйе популяцияларында генетикалық әртүрлілікті қолдау үшін егжей-тегжейлі басшылықтың негізі болады. Іріктеу жолдары туралы зерттеудің бір бөлігі коммерциялық SNP микрочиптерін жасау үшін пайдалы геномдық аймақтар мен маркерлерді анықтайды.
Рецензияланған журналдардағы жарияланымдар:
- Web of Science базасының Science Citation Index Expanded индекстелетін және (немесе) Scopus базасында citescore бойынша кемінде 50 (елу) процентилі бар рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 3 (үш) мақала және (немесе)шолулар;
- өнертабысқа кемінде 1 патент (ол бойынша оң шешімді қоса алғанда);
- КОКНВО ұсынған рецензияланатын шетелдік немесе отандық басылымда кемінде 2 (екі) мақала немесе шолулар;
Жобаны іске асыру қорытындылары бойынша (ғылымның тиісті бағыты бойынша):
- кемінде 1 (бір) философия докторы (PhD) немесе бейіні бойынша доктор даярлау (докторантура бойынша жоғары оқу орнынан кейінгі білім алуға лицензиясы бар ЖЖОКБҰ-мен бірлесіп даярлауға жол беріледі). Бұл ретте диссертацияны жоба аяқталғаннан кейін 2 (екі) жылдан кешіктірмей қорғауға болады;
Бұл жоба Қазақстан түйелерінің популяциясындағы генетикалық әртүрлілікті сақтауға, инбридинг деңгейін анықтауға және осылайша түйе фермаларында инбридинг салдарынан депрессия мен экономикалық шығындардың алдын алуға көмектеседі.
Әлеуетті пайдаланушылар үшін ақпарат
Түйе фермерлері мен селекционерлері үшін
Жоба Қазақстандағы ауыл шаруашылығы өндірушілерінің алдында тұрған практикалық мәселелерді шешуге бағытталған.
Геномдық селекция: фермерлер геномдық іріктеу құралдарына (мысалы, үнемді SNP микрочиптері) қол жеткізе алады, бұл ерте жаста жақсы генетикалық әлеуеті бар жануарларды таңдауға мүмкіндік береді.
Өнімділікті арттыру: зерттеу нәтижелерін пайдалану сүт сүті, өсу қарқыны және ет сапасы сияқты экономикалық маңызды белгілерді жақсартуға көмектеседі.
Экономикалық пайда: ғылыми негізделген өсіру бағдарламаларын енгізу рентабельділікті арттырады және жергілікті шаруашылықтар үшін жаңа экономикалық мүмкіндіктер ашады деп күтілуде.
Асыл тұқымды ұйымдар мен қауымдастықтар үшін
Асылдандыру стратегиялары: ұйымдар қазақстандық түйелерді өсіру және сақтау бойынша жан-жақты жоспар мен ғылыми негізделген ұсынымдар алады.
Генофондты бақылау: нәтижелер инбридинг (туыстық крест) деңгейін жақсырақ бақылауға және бірегей экотиптердің генетикалық әртүрлілігін сақтауға мүмкіндік береді.
Элиталық ядроны құру: зерттеу қазақстандық түйелердің элиталық асыл тұқымды ядросын қалыптастыру үшін негіз қалайды.
Ғылыми қоғамдастық (жергілікті және халықаралық) үшін
Бірегей датасет: қазақстандық түйелердің толық геномдық секвенирлеу (WGS) деректерінің алғашқы толық жиынтығы жасалатын болады, ол болашақ зерттеулер үшін "референттік популяцияға" айналады.
Бейімделу туралы жаңа білім: ғалымдар түйелердің экстремалды климаттық жағдайларға (жылу, суық, құрғақшылық) бейімделуінің генетикалық механизмдері туралы мәліметтер алады.
Халықаралық ынтымақтастық: жоба қазақстандық мекемелерге түйе геномикасы саласындағы әлемдік зерттеулердің көшбасшыларының қатарына кіруге және жаһандық жобаларға қатысуға мүмкіндік береді.
Мемлекеттік органдар және аграрлық сектор үшін
Азық-түлік қауіпсіздігі: мал шаруашылығының өнімділігін жақсарту елдің әлеуметтік-экономикалық дамуына және азық-түлік қауіпсіздігін нығайтуға тікелей ықпал етеді.
Саланы жаңғырту: жоба дәстүрлі түйе шаруашылығын геномдық технологияларға негізделген заманауи секторға айналдыруға ықпал етеді.
Климатқа төзімділік: төзімділік белгілерін анықтау салаға жаһандық жылынуға және басқа да экологиялық қиындықтарға бейімделуге көмектеседі.
Пайдалану үшін практикалық нәтижелер:
Ұсыныстар: фермерлер мен қауымдастықтарға тиімді өсіру бойынша нұсқаулық.
Селекциялық маркерлер: жоғары өнімділік пен бейімделуге байланысты генетикалық маркерлердің тізімі (SNPs).
Патенттер: селекцияға арналған жаңа генетикалық маркерлерді ықтимал патенттік қорғау.
Зерттеу тобының мүшелері
1. Усенбеков Есенғали Серикович
биология ғылымдарының кандидаты, профессор
Scopus Author ID: 56465995700
Researcher ID: rid93491
ORCID: 0000 0001 9508 4179
2. Ниязбекова Жаннұр Нұрділдақызы
PhD
Scopus Author ID: 57219625341
ORCID: 0000-0002-8556-0212
3. Муслимова Жадыра Умирбекқызы
PhD
Scopus Author ID: 58820604900
Researcher ID: co/rid97596
ORCID: 0000-0003-3485-7240
4. Бағдат Айгерім Бағдатқызы
PhD
Scopus Author ID: 57577615400
ORCID: 0000-0001-9825-6132
5. Баймирзаев Бекзат Кайратович
ветеринария ғылымдарының магистрі
ORCID: 0009-0001-0923-4511
6. Маханбетұлы Нұрсұлтан
ветеринария ғылымдарының магистрі
ORCID: 0000-0002-9433-302X