Жоба туралы
Жоба жетекшісі
Белоусов Вячеслав Юрьевич
кандидат биологических наук
Scopus Author ID: 58030218400
Researcher ID: AEK-7910-2022
ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1922-156X
Өзектілігі
Дүниежүзілік денсаулық сақтау ұйымы дүние жүзінде әрбір бесінші өлімге әкелетін сепсиспен күресу үшін жаһандық әрекетке шақырады. Дүниежүзілік денсаулық сақтау ұйымының сепсис туралы алғашқы жаһандық есебінде сепсиспен күресу күш-жігеріне ғылыми және клиникалық білімдегі, әсіресе табысы төмен және орташа елдерде, оның ішінде Қазақстанда айтарлықтай олқылықтар кедергі келтіретіні көрсетілген.
Сепсистің негізгі патогенезі әлі толық зерттелмеген және күрделі жүйелік қабыну желісі әсерлерін, гендік полиморфизмдерді, иммундық дисфункцияны, қанның қалыптан тыс ұюын, тіндердің зақымдануын және әртүрлі жұқпалы қоздырғыштарға және олардың токсиндеріне иенің анормальды жауаптарын қамтиды. Сепсис организмнің көптеген жүйелері мен мүшелерінің патофизиологиялық өзгерістерімен тығыз байланысты, ал сепсистің патогенезі әлі де қосымша зерттеуді қажет етеді. Бұл факт ақпараттық биомаркерлерді іздеуді қиындатады, олардың саны қазіргі уақытта ондаған және жүздегенді құрайды.
Мақсаты
Сепсис биомаркерлері мен эндотиптерін анықтауға арналған салыстырмалы транскриптомды талдау, жоғары өнімділік секвенциясы (NGS RNA-seq). Жобаның нәтижесінде транскриптомның салыстырмалы талдауы бір мезгілде қан мен зәр үлгілеріне, сепсиспен ауыратын және сау болып көрінетін науқастардың топтарында аурудың ауырлығы мен сепсис нәтижелерін, оның ішінде қоздырғыштың оқшаулануы, идентификациясы және микробқа қарсы сезімталдығы.
Күтілетін және/немесе қол жеткізілген нәтижелер
NGS көмегімен RefSeq дерекқорына енгізілген 20 800-ден астам адам гендерінің экспрессиясына негізделген транскриптомды талдау деректері зерттелетін топтардың экспрессиялық профильдеріндегі айырмашылықтарды анықтайды, сондай-ақ сепсиске тән эндотиптердің болуын растайды деп күтілуде. әдебиеттерде сипатталған асқынулар мен өлім қаупі. Осы жолмен алынған гендердің дифференциалды экспрессиясы (DEGs) және эндотиптері туралы деректер, жалпы алғанда, сепсис кезіндегі молекулалық және жасушалық процестерді түсінуді жақсартуға көмектеседі, сонымен қатар болашақта бұл деректерді спецификалық таңдау үшін пайдалануға мүмкіндік береді. диагностикалық тест жүйесін кейіннен құру және пайдалану мақсатында биомаркерлер. Бұл жобаның сәтті аяқталуы Қазақстан Республикасында тек медицинаның ғана емес, сонымен қатар жаратылыстану ғылымдарының әр түрлі салаларында транскриптомиялық әдістерді кеңінен енгізу және дамыту үшін ынталандыру болады, сонымен қатар Қазақстан Республикасындағы ғылыми-зерттеу жұмыстарына жақсы негіз болады. осы бейіндегі мамандарды даярлау.
Әлеуетті пайдаланушылар үшін ақпарат
Тұңғыш рет қоздырғышты, оның микробқа қарсы препараттарға төзімділігін анықтауды қоса алғанда, сепсиспен ауыратын науқастардың және анық сау пациенттердің бақылау тобынан алынған веноздық қан мен зәр үлгілерінде NGS көмегімен транскриптомның салыстырмалы талдауы жүргізіледі; зерттелетін үлгілер мен топтардағы дифференциалды ген экспрессиясын (DEG) талдау; патогендерді анықтау және микробқа қарсы сезімталдық, аурудың ауырлығы мен нәтижесі туралы деректермен экспрессияның корреляциясын талдау, сондай-ақ DEG және сепсис эндотиптерінің нәтижелерін қолда бар әдебиет деректерімен салыстыру. NGS RNA-seq негізіндегі молекулярлық-генетикалық диагностика әдістерін қолдану аурудың ауырлығымен және оның нәтижелерімен байланысты сепсистің пайда болу және ағымын жақсырақ түсінуге ғана емес, сонымен қатар ПТР негізінде жылдам, дәл және салыстырмалы түрде арзан емес диагностикалық және болжамды сынақ жүйесін құру үшін практикалық мақсаттар үшін алынған деректер.
Зерттеу тобының мүшелері
1. Сандыбаев Нурлан Тамамбаевич
б.ғ.к., профессор
Scopus Author ID: 37000362400
Researcher ID: AAO-4831-2021, M-7802-2015
ORCID: http://orcid.org/0000-0003-1814-2798
2. Лавриненко Алена Владимировна
PhD
Scopus Author ID: 57193763117
https://orcid.org/0000-0001-9436-8778
3. Строчков Виталий Михайлович
Scopus Author ID 37000312900
ORCID: http://orcid.org/0000-0003-3399-2942
4. Соломадин Максим Валерьевич
Researcher ID Web of Science GZB-1407-2022
http://orcid.org/0000-0003-4219-1055
5. Егоров Сергей Валентинович
PhD
ORCID: http://orcid.org/0000-0002-7136-7921
6. Айтпенов Талгат Батырович